Je ne suis pas un expert donc je ne peux que partager mon expérience.
Moi j'utilise l'AF en entrée, mais je garde la carte son du Mac en sortie, branchée sur mes enceintes de monitoring. Certainement pas le mieux mais ça m'éviter de refaire 25 branchements après les répétitions. Parfois, je branche mes enceintes directement sur l'AF. Chez moi je ne fais que des maquettes "à l'arrache" pour poser des compos. Je ne mixe / mastérise pas.
A tester : si tu mets l'output 1à 0 (sur la façade de l'AF) et que tu mets l'AF en entrée ET sortie, est-ce que tu n'obtiens pas ce que tu veux ? Il me semble que le niveau d'enregistrement est indépendant du niveau de l'output 1 ou 2 (mais pas sûr).
Par ailleurs, je fais mes prises de son voix avec un Voicelive 2, branché en USB également. Avec GarageBand, c'est la misère (plantages réguliers quand l'AF et le VL sont branchés en même temps).